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title: BDE-db
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repository: ai4s/BDE-db
last_updated: 2025-09-08
license: "MIT License"
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downloads: 31
stars: 1
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# BDE-db

> BDE-db - ai4s 在 ModelScope 开源的数据集。分子属性预测、 反应:量化计算、分子:计算性质

ai4s/BDE-db 是 ModelScope 魔搭社区上的数据集，存储大小 31 MB，采用 MIT License 许可。

- **Repository**: ai4s/BDE-db
- **License**: MIT License
- **Storage size**: 31 MB
- **Downloads**: 31
- **Stars**: 1
- **Last updated**: 2025-09-08

Source: https://www.modelscope.cn/datasets/ai4s/BDE-db

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#### 数据集说明
**BDE‑db** 是一个收录了 超过二十万个小有机分子（C, H, O, N 构成，重原子不超过10）上同裂解键断裂焓（homolytic bond dissociation enthalpies, BDEs）的数据库
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## 1. 数据库定义与背景
**BDE‑db** 是一个收录了 超过二十万个小有机分子（C, H, O, N 构成，重原子不超过10）上同裂解键断裂焓（homolytic bond dissociation enthalpies, BDEs）的数据库，最初由 Peter St. John 等人在 2019 年构建并开放发布，目的是为化学反应能量研究与机器学习模型开发提供标准数据集。所有焓值均基于 **M06‑2X/def2‑TZVP** 水平通过 DFT（Gaussian 16）计算得出，单位为 kcal/mol 。
### 2. 数据内容与结构
| 内容项       | 说明                                                                                                                  |
| -------------- | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
| 分子范围     | 来自 PubChem 的中性有机分子，共 42,557 个化合物，C/H/O/N 构成。                                                       |
| BDE 计算样本 | 针对每个分子中所有非环单键进行同裂解，生成对应自由基产物。DFT 计算涵盖父分子与产物，最终形成 290,664 条键断裂焓数据。 |
| 数据格式     | 包括 SMILES 表示、键位点、对应 BDE 值（kcal/mol），通常以 CSV/DFT raw 数据形式存储于 GitHub 或 Figshare。
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## 3. 功能特点与应用
* 高质量计算数据：使用 M06‑2X/def2‑TZVP 方法的 DFT 数据，适合训练高精度化学预测模型
* 机器学习集成：BDE‑db 已用于 ML 模型（如 GNN）训练，近似达到化学精度，误差通常低于 1 kcal/mol；支持快速预测。

#### 下载方法 
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